קרן השתלמות היא כלי חיסכון לטווח בינוני המזכה בהטבות מס משמעותיות. לעצמאים, ההפקדה לקרן מוכרת כהוצאה עסקית עד לתקרה שנתית, ובכך מקטינה את הרווח החייב. בנוסף, הרווחים בקרן פטורים ממס בתנאים. ההפקדה משולמת על ידי העצמאי כ"מעביד" וכ"עובד". קרן ההשתלמות נזילה יחסית — ניתן לפדות את הכסף לאחר 6 שנים (במסלול רגיל) בתנאים, ובכך היא משמשת גם כחיסכון לפרישה וגם כקרן חירום עסקית. תכנון נכון של ההפקדות ממקסם את ההטבה מבלי לפגוע בתזרים.