חשבונית מס היא מסמך רשמי המונפק על ידי עוסק מורשה, המפרט את העסקה וכוללת מע"מ. חשבונית המס מהווה את התיעוד החשבונאי של העסקה ומאפשרת ללקוח לקזז את המע"מ. עוסק פטור אינו מנפיק חשבוניות מס, אלא קבלות על עסקאותיו — או חשבונית ישראל באמצעות מספר הקצאה כשהלקוח דורש זאת. ניהול פנקס חשבוניות מס דיגיטלי מאפשר מעקב שוטף, דיווח מדויק למע"מ ומניעת טעויות. הקפדה על פרטי החשבונית היא חלק בלתי נפרד מניהול ספרים תקין.